海洋生态专业委员会成立以来，积极搭建全国性海洋生态学术交流平台，举办一系列的全国海洋生态学术研讨会，介绍国际上海洋生态方面最新研究进展，交流国内外海洋生态领域最新研究成果，推动海洋生态学科发展。2010年以来共举办九届全国海洋生态研讨会暨中国生态学学会海洋生态专业委员会年学术年会。
2022年海洋生态专委会及其骨干单位共主办高水平学术研讨会7次，累计参会1148人次，会议交流口头报告203个；举办了海洋生态主题科普活动16次，参与组织和举办活动的教师、科研人员和研究生等共125人次，受众共54563人次。
