流域生态专业委会成立以来开展了一系列决策咨询、学术会议和考察调研等活动。在决策咨询活动方面，流域专委会于2018年4月在“长白山生态保护与可持续发展学术研讨会”上为长白山可持续发展建言献策，在接受《人民日报》记者专访时畅谈了流域生态学的发展历程及在服务长江经济带绿色国家重大战略中的作用。在学术会议方面，流域专委会2018年在福州主办了“首届流域生态论坛”，在大连组织了第五届生态毒理学学术研讨会的“水生态系统生物完整性评价专题学术讨论会”分会场，在南京组织了第十七届中国生态学大会的“流域生态与长江经济带绿色发展主题分会”、在南京组织了第34届国际湖沼学大会“多元环境压力下基于性状分析的方法在水生环境研究和管理中的应用主题分会”。在考察调研方面，专委会多次组织顾问和专家在浙江和福建等地进行东南沿海诸河流域进行现场考察活动，与浙江省北仑区和宁海县、福建省周宁县等地方政府领导进行座谈交流，形成流域生态科学与管理的地方共识：以东南沿海流域水系为案例系统性地研究气候变化和城镇化耦合驱动下的流域环境与生态响应机制以及水利、环境、生态等基础设施的协调规划建设和长效运行模式，对促进辖区内流域可持续发展及生态文明建设具有重要的科学价值和现实意义。